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應用纖維素酶現在已廣泛地應用于紡織、日用化工、造紙、食品發酵、工業洗滌、煙草、石油開采、廢水處理及飼料等各個領域，其應用前景十分廣闊。天然纖維素酶存在于微生物、某些昆蟲和植物中。植物種子萌發時，纖維素酶水解種皮纖維素，利于出苗。草食反芻動物內的共生細菌和原生動物能分泌纖維素酶，將纖維素水解為可被吸收的糖。利用微生物分泌的纖維素酶進行農副產品加工，可生產優質飼料和葡萄糖。農業上應用綠色木霉(富含纖維素酶的一種真菌)進行飼料發酵，可提高纖維素類飼料的Chemicalbook營養價值。

纖維素酶在畜禽生產中的應用：

常見的畜禽飼料如谷物、豆類、麥類及加工副產品等都含有大量的纖維素。除了反芻動物借助瘤胃微生物可以利用一部分外，其它動物如豬、雞等單胃動物則不能利用纖維素。

以下是纖維素酶在牛、雞、豬日糧中的應用：

牛日糧

焦平林等（1996）用閹牛試驗，在日糧中按每頭每日添加纖維素酶40g，飼喂60天，結果表明加酶組日增重892.78g，對照組日增重746.8g，差異極（P<0.01）。